Résumé: Enterococcus faecium représente une menace majeure pour la santé publique mondiale, en particulier chez les patients à haut risque, et l'émergence de souches résistantes à la vancomycine (ERV) a considérablement limité les options thérapeutiques. Dans cette étude, nous avons réalisé une analyse génomique complète de deux isolats cliniques d'ERV de type vanA . Ces deux souches ont été isolées à 20 jours d'intervalle, à partir d'infections du site opératoire (ISO) chez deux patientes hospitalisées en obstétrique-gynécologie pour des infections de plaies post-opératoires. Un profil de sensibilité aux antibiotiques, un séquençage du génome entier (SGE) et des analyses bioinformatiques ont été effectués afin d'étudier les plasmides, le résistome et la parenté génomique avec les génomes d'E. faecium déjà publiés . Les deux isolats ont été identifiés comme appartenant au type de séquence ST80 du complexe clonal CC17 et présentent une forte parenté, seulement 8 gSNP les distinguant. Ils présentent un phénotype de multirésistance aux antibiotiques, médié par la présence de gènes de résistance à la vancomycine, aux aminoglycosides et aux macrolides. L' opéron vanA a été identifié dans un élément de type transposon Tn1546 sur le plasmide rep17 , qui porte également le locus 3 : [ ant(6)-sat(4)-aph(3') ], suggérant la possibilité de son transfert dans un génome staphylococcique, comme cela a été récemment rapporté. Notre étude décrit les caractéristiques génomiques de deux isolats cliniques de VREfm ST80, porteurs d'un plasmide rep17 contenant le gène vanA , en Algérie, et met en évidence la présence du clone épidémique de VREfm ST80 évoluant en milieu hospitalier.

Résumé: Background: Surgical site infections (SSIs) are one of the most common health care–associated infections in low and middle-income countries. The aims of this cross-sectional descriptive study were to estimate the frequency of postcaesarean infection with associated clinical characteristics and the antibiotic resistance profile of bacterial isolates. Methods: Patients who underwent a cesarean section at the obstetrics and gynecology department of the hospital in Annaba, Algeria were included. Each woman was followed postoperatively for 30 days and so ciodemographic data were collected. Culture-based microbiological methods were used to identify the causative bacteria and determine their antibiotic resistance phenotype and molecular characterization. Results: Among 1,810 patients, we recorded 36 (1.9%) SSIs. Most patients had undergone an emergency delivery (75%) and low educational level (72.2%). The most frequent maternal pathologies were Body Mass Index ≥ 30 (63.9%), scarred uteri (58.3%), anemia (55.6%), and an American Society of Anaesthesiologists score between II and III (33.3%). Of the 43 bacteria isolated, Enterobacteriaceae were the most frequent (62.8%), predominated by Escherichia coli strains (43.5%), a majority of which were extended-spectrum β- lactamases carriers (62.9%). Although gram-positive cocci were less frequent (37.2%), a majority of Enterococcus faecalis (56.2%) were observed and 2 strains of vancomycin-resistant Enterococcus faecium harboring the vanA gene were identified. Conclusions: Extensive surveillance of at-risk populations should be integrated to prevent the occurrence of SSIs.

Résumé: Objectif : Le cancer du sein est une maladie hétérogène présentant divers sous-types biologiques et cliniques. Le statut HER2 (récepteur 2 du facteur de croissance épidermique humain) est un biomarqueur crucial, associé à un comportement tumoral agressif et à un mauvais pronostic. Des modèles algorithmiques avancés peuvent contribuer à la prédiction de la croissance tumorale et des métastases, constituant ainsi de précieux outils cliniques pour la classification et le traitement. L’efficacité des stratégies thérapeutiques en oncologie repose sur une prise de décision précise et l’identification précoce des facteurs associés à des résultats positifs. Le cancer du sein présente des difficultés pour comprendre ses facteurs contributifs et établir des méthodes diagnostiques précises. Notre recherche introduit une méthode novatrice utilisant des techniques d’apprentissage automatique pour explorer la relation entre diverses variables cliniques et moléculaires, en se concentrant sur la prédiction du statut du récepteur 2 du facteur de croissance épidermique humain (HER2), un biomarqueur clé de l’agressivité du cancer du sein. Cet objectif s’inscrit dans la perspective de l’utilisation de l’intelligence artificielle pour faciliter la prise de décision et répondre aux enjeux diagnostiques pendant le traitement. Méthodes : Quatre modèles d’apprentissage automatique, à savoir la régression logistique, les forêts aléatoires, LightGBM et CatBoost, ont été implémentés et évalués à l’aide de Python. L'ensemble de données a été constitué à partir des dossiers médicaux de patientes atteintes d'un cancer du sein, couvrant la période 2018-2020. La performance prédictive du modèle a été évaluée à l'aide de l'exactitude, de la précision, du rappel et du score F1. Résultats : Les modèles ont atteint des exactitudes variables, comprises entre 86,36 % et 95,45 %. Le modèle de régression logistique a obtenu une exactitude de 90,90 %, tandis que les modèles de forêt aléatoire et LightGBM ont atteint une exactitude de 86,36 %. Le modèle CatBoost s'est distingué par une exactitude supérieure de 95,45 %, démontrant ainsi ses excellentes capacités de prédiction du statut HER2. Les modèles d'apprentissage automatique ont démontré leur potentiel pour la prédiction du statut HER2, permettant un dépistage précoce et facilitant l'élaboration de stratégies de traitement personnalisées. Conclusion : Nos résultats soulignent l'importance des techniques d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique pour améliorer la prise en charge du cancer du sein et orienter les décisions thérapeutiques. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour explorer les applications plus larges de l'apprentissage automatique dans la prédiction des résultats globaux du cancer du sein, dans divers contextes de soins et au sein de populations hétérogènes. Mots clés Cancer du sein décision clinique HER2 apprentissage automatique Précision des prédictions

Résumé: Recently, a significant number of breast cancer (BC) patients have been diagnosed at an early stage. It is therefore critical to accurately predict the risk of recurrence and distant metastasis for better management of BC in this setting. Clinicopathologic patterns, particularly lymph node status, tumor size, and hormonal receptor status are routinely used to identify women at increased risk of recurrence. However, these factors have limitations regarding their predictive ability for late metastasis risk in patients with early BC. Emerging molecular signatures using gene expression-based approaches have improved the prognostic and predictive accuracy for this indication. However, the use of their based-scores for risk assessment has provided contradictory findings. Therefore, developing and using newly emerged alternative predictive and prognostic biomarkers for identifying patients at high- and low-risk is of great importance. The present review discusses some serum biomarkers and multigene profiling scores for predicting late recurrence and distant metastasis in early-stage BC based on recently published studies and clinical trials.

Résumé: Background: Acute toxoplasmosis in pregnant women presents a high risk of Toxoplasma transmission to the fetus. Early diagnosis is difficult, especially when serological testing for IgG/IgM antibodies fail to differentiate between a recent and a past infection. In this case, we rely on IgG avidity or PCR assays. Objectives: The aim of this study was to compare conventional ELISA and IgG avidity, with PCR using B1 and P30 primers for the early diagnosis of toxoplasmosis in pregnant women. Methods: Sera were collected from 143 pregnant women and measured by ELISA for anti-Toxoplasma IgG, IgM, IgA and IgG avidity. DNA was extracted from 57 peripheral blood and 14 amniotic fluid samples for PCR amplification. Results: A total of 57 out 143 women were seropositive: 30 (52.6%) were IgG+/IgM-and 27 (43.8%) were IgG+/IgM+; IgA antibodies were positive in 7 (12.2%) cases. IgG avidity was low in 9 women suggesting an acute infection; 3 women presented an intermediate avidity. PCR detected Toxoplasma DNA in 9 women presenting low avidity and was negative for the intermediate avidity cases. Conclusion: PCR combined to avidity IgG performed better than ELISA IgG, IgM and/or IgA assays alone. PCR was useful in the case of intermediate avidity.

Résumé: Health research capacities have been improved in Africa but still remain weak as compared to other regions of the World. To strengthen these research capacities, international collaboration and networking for knowledge and capacity transfer are needed. In this commentary, we present the Network for Scientific Support in the field of Sexual and Reproductive Health in West and North Africa, its priority research topics and discuss its implementation process. Established in January 2014, the Network aims at generating human rights and gender-based research fully carried out and driven by South based institutions. It is composed of 12 institutions including the Institute of Tropical Medicine of Antwerp (Belgium) and 11 institutions from eight Francophone West and North African countries. The key areas of interest of this network are health policies analysis and health system research in family planning, HIV prevention among vulnerable groups, quality of care and breast cancers. Since it started, seventeen research proposals based on locally relevant research questions have been developed. Among the seventeen proposals, eleven have been implemented. Several research institutions enhanced linkages with local representations of international partners such as UNFPA. The network is committed to strengthening methodological research capacities and soft skills such as fundraising, advocacy and leadership. Such competencies are strongly needed for developing an effective South-based leadership in Sexual and Reproductive Health research, and for achieving the Sustainable Development Goals. Keywords: Sexual and reproductive health, Research capacity, Africa, Networking, Implementation, Collective intelligence, Switching the pole

Résumé: Background The possible role of viruses in breast cancer etiology remains an unresolved question. We hypothesized that if some viruses are involved, it may be in a subgroup of breast cancers only. Epidemiological arguments drove our interest in breast cancer subgroups that are more frequent in Africa, namely inflammatory breast cancer (IBC) and triple-negative breast cancer. We tested whether viral prevalence was significantly higher in these subgroups. Materials and Methods One hundred fifty-five paraffin-embedded malignant breast tumors were randomly selected at the pathology laboratory of the University Hospital of Annaba (Algeria) to include one third of IBC and two thirds of non-IBC. They were tested for the presence of DNA from 61 viral agents (46 human papillomaviruses, 10 polyomaviruses, and 5 herpesviruses) using type-specific multiplex genotyping assays, which combine multiplex PCR and bead-based Luminex technology. Results Viral DNA was found in 22 (17.9%) of 123 tumors. The most prevalent viruses were EBV1 and HPV16. IBC tumors carried significantly more viruses (any type) than non-IBC tumors (30% vs. 13%, p<0.04). Similarly, triple-negative tumors displayed higher virus-positivity than non-triple-negative tumors (44% vs. 14%, p<0.009). Conclusions Our results suggest an association between the presence of viral DNA and aggressive breast cancer phenotypes (IBC, triple-negative). While preliminary, they underline the importance of focusing on subgroups when studying viral etiology in breast cancer. Further studies on viruses in breast cancer should be conducted in much larger samples to confirm …

Résumé: Background: Prenatal HIV testing is a cornerstone of strategies aimed at eliminating mother-to-child transmission (eMTCT). In Algeria, a low-prevalence country, up-to-date regional data on HIV seroprevalence and testing acceptability remain scarce. Objectives: To estimate HIV seroprevalence among pregnant women and to assess the acceptability of prenatal HIV testing across three wilayas in eastern Algeria. Methods: A multicenter crosssectional study was conducted between 2016 and 2017 in 13 public prenatal care facilities in the wilayas of Annaba, Skikda, and Tébessa. Consenting pregnant women aged 18 years or older were enrolled. HIV testing was performed using a rapid test and confirmed in accordance with the national algorithm. Associated factors were explored through bivariate analysis, with estimation of odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs). Results: Of 11,601 women who received counseling, 7,677 agreed to be tested, yielding an overall testing acceptability rate of 66.17%. Acceptability was significantly higher in semi-urban areas (80.1%) than in urban settings (55.9%), and in maternal and child health centers (81.9%) compared to maternity wards (50.1%). Eight HIV-positive cases were confirmed, corresponding to a seroprevalence of 1.04‰ (95% CI: 0.45–2.05), which was higher in urban areas (1.335‰) than in semi-urban areas (0.763‰). Partner's geographic mobility was strongly associated with HIV seropositivity (OR = 25.6; 95% CI: 6.37–103.0; p < 0.001). Conclusion: Although HIV seroprevalence remains low in this region, prenatal testing acceptability is a cause for concern, particularly in urban settings. Partner mobility emerges as a major vulnerability factor. Strengthening routine HIV testing within antenatal care, alongside greater involvement of healthcare providers and male partners, is essential to achieving eMTCT targets.

Résumé: La prééclampsie (PE) est un trouble hypertensif spécifique de la grossesse associée à de graves complications maternelles et fœtales. Les modèles pronostiques basés uniquement sur les facteurs de risque classiques (hypertension artérielle et protéinurie) ont montré des valeurs prédictives faibles. L’objectif de cette étude est d’évaluer les valeurs prédictives des marqueurs angiogéniques Placental Growth Factor (PlGF) et soluble Fms-like tyrosine kinase 1 (sFlt-1) et des marqueurs clinico-biologiques conventionnels dans l’estimation du pronostic maternofœtal au cours de la prééclampsie. Matériel et méthodes : Il s’agit d’une étude cas-témoins nichée dans une cohorte de 405 gestantes recrutées au niveau des services de Gynécologie-Obstétrique de la wilaya d’Annaba et de Guelma. Les marqueurs angiogéniques (PIGF sFlt-1) et les paramètres biochimiques sanguins et urinaires d’intérêt dans la PE ont été dosés au deuxième trimestre de la grossesse (≥ 20 Semaines d’aménorrhée). Résultats : Les prééclamptiques ayant eu des issues materno-fœtales défavorables (IMFD) ont présenté des taux moyens de sFlt-1 et du ratio sFlt-1/PlGF significativement plus élevés comparées aux prééclamptiques sans complications (8562,94 ± 1138,00 versus 5526,61 ± 959,02 pg/ml et 226,03 ± 120,25 versus 70,45 ± 33,37, respectivement). L’analyse de régression logistique bivariée a révélé l’existence d’une association statistiquement significative entre le risque de survenue d’une IMFD chez les gestantes prééclamptiques et des taux de sFlt-1 et du ratio sFlt- 1/PlGF supérieurs aux 95ème percentiles (OR= 5,78 et OR=12,31 respectivement). Conclusion : Les paramètres actuels de diagnostic et de dépistage de la PE ne sont pas suffisamment sensibles ni spécifiques pour évaluer la sévérité et prédire les complications d’une prééclampsie avérée. Les marqueurs angiogéniques pourraient présenter un intérêt pronostique dans la survenue des IMFD. Mots clés prééclampsie ; ratio sFlt-1/PlGF ; issues materno-fœtales défavorables ; pronostic.

Résumé: Introduction: Preeclampsia is a specific hypertensive disorder of pregnancy associated with severe maternal and fetal complications. Prognostic models based only on classical clinic-biological risk factors (hypertension and proteinuria) have shown low predictive values. The aim of this study was to evaluate the predictive values of the angiogenic markers Placental Growth Factor (PlGF) and soluble Fms-like tyrosine kinase 1 (sFlt-1) in predicting maternal-fetal prognosis during preeclampsia. The objective of this study is to evaluate the predictive values of the angiogenic markers Placental Growth Factor (PlGF), soluble fms-like tyrosine kinase 1 (sFlt-1) and conventional clinical biological markers in assessing maternal-fetal prognosis during preeclampsia. Material and Methods : This is a nested case-control study in a cohort of 405 pregnant women recruited in the Gynaecology-Obstetrics departments of Annaba and Guelma regions. The determination of angiogenic markers (PIGF sFlt-1) and biochemical blood and urine parameters of interest in EP was performed in the second trimester of pregnancy (20 weeks of amenorrhea). Results: Preeclamptics with adverse maternal-fetal outcomes (AMFO) had significantly higher mean sFlt-1 level and a significantly higher sFlt-1/PlGF ratio compared with preeclamptics without complications (8562.94 ± 1138.00 versus 5526.61 ± 959.02 pg/ml and 226.03 ± 120.25 versus 70.45 ± 33.37, respectively). Bivariate logistic regression analysis revealed a statistically significant association between the risk of developing AFMO in preeclamptic pregnancies and sFlt-1 levels and sFlt-1/PlGF ratio above the 95th percentiles (OR= 5.78 and OR=12.31, respectively). Conclusion: Current diagnostic and screening parameters for EP are not sufficiently sensitive or specific to assess the severity and predict the complications of established preeclampsia. Angiogenic biomarkers may have prognostic value in the occurrence of AMFO.

Résumé: L’objectif de cette étude est de déterminer l’incidence du cancer du sein chez la femme dans la wilaya d’Annaba au cours de la période 2004–2014. Décrire les caractéristiques épidémiologiques et histologiques de ce cancer. C’est une étude descriptive de tous les cas de cancer du sein primitif et invasif survenus dans la population de femmes de la wilaya d’Annaba entre 2004 et 2014. Les données ont été extraites à partir du registre du cancer d’Annaba. Les définitions des paramètres, les principes et méthodes d’enregistrement sont communs à tous les registres du cancer soutenus par le Centre International de Recherche sur le Cancer. Les variables étudiées étaient des variables relatives aux données démographiques et histopathologiques des cas. Les localisations retenues étaient celles codés entre C50.0 à C50.9 selon la CIM-O-3. 1451 cas de cancers primitifs du sein ont été recensés durant la période d’étude avec un taux de vérification microscopique de 95%. L’incidence de la période 2004 à 2014 du cancer du sein à Annaba était de l’ordre de 45,6 cas/100 000 femmes-années avec un taux assez élevé pour l’année 2013. Ce résultat est concordant avec plusieurs données d’autres registres d’Afrique du Nord. Les caractéristiques du cancer du sein dans la Wilaya d’Annaba ne diffèrent pas notablement de celles des pays de l’Afrique du Nord. Il est important d’améliorer l’enregistrement des variables relatives au stade de diagnostic au niveau du registre. Ces données permettront de mesurer l’impact des actions entreprises dans la lutte contre le cancer du sein (sensibilisation, dépistage, ….etc.) Mots clés : incidence, cancer du sein, Annaba ملخص

Résumé: Il s’agit d’une étude descriptive à recueil prospective incluant 196 cas de cancers du sein pris en charge au niveau du service de gynécologie obstétrique de l’établissement hospitalier spécialisé mère enfant Abdallah Nouaouria ‘El Bouni’’ Annaba entre 1er avril 2012 et 31mars 2013. L’objectif est de déterminer les caractéristiques sociodémographiques, cliniques et thérapeutiques du cancer du sein. L’âge moyen de découverte est de 46.04 + 9.78 ans (extrêmes: 25 et 70 ans). La majorité de nos patientes soit 82% ont un niveau socio-économique moyen. L’âge moyen de la ménarchie est de 13 + 2.2 ans, l’âge moyen de mariage est de 22.08 + 11.68 ans. La parité moyenne des femmes est 2.8+ 1.93 enfants. Le délai moyen de consultation est de 7.37 mois (extrêmes : 10 jours et 72 mois). Cette consultation est le plus souvent motivée par la découverte d’un nodule du sein dans 94% des cas, lors de l’autopalpation dans 100 % des cas. La taille clinique de la tumeur moyenne est 40.86 + 21.28 mm (extrêmes : 10 mm à 120mm). Le type histologique le plus fréquent est le carcinome canalaire infiltrant, retrouvé dans 68.36 % des cas, avec présence d’emboles vasculaires dans 54.6%. La forme triple négative a représenté 26.95%. La majorité des patientes ont reçu un traitement multimodal associant une chirurgie radicale dans 95.41%, suivie d’une chimiothérapie dans 97.95% des cas, d’une radiothérapie, une thérapie ciblée et d’une hormonothérapie selon le profil immuno-histochimique de la tumeur. Ce travail nous a permis de montrer que malgré les efforts déployés pour améliorer la prise en charge du cancer du sein dans notre région, le diagnostic reste souvent tardif ce qui expose les patientes à un traitement mutilant, lourd et couteux. Mots-clés : cancer - Sein - Épidémiologie - Clinique – traitement